Après le succès du Protocole 2W, Nyna se remet difficilement de la disparition de Komo. Elle en est convaincue : une partie de son frère est toujours présente dans les eaux du Stream, et elle compte bien le prouver. Et si Komo tentait de la contacter? Avec l'aide des hackers Sid et Fréia, elle se met en tête de trouver la trace de son frère dans l'intelligence artificielle qui régit le Stream. Mais cela n'est pas une tâche aisée, car le système semble leur refuser l'accès. Alors que la presse se déchaîne sur la centrale, le laboratoire génétique met au point un sérum pour soulager Fury des effets du virus, et Darian se retrouve impliqué dans la vie politique d'Hakinahi...