Dos historias separadas por casi 500 años hacen del monasterio de El Escorial, joya arquitectónica universal, el centro de esta novela. Por un lado Miguel Antona, el bufón real de Felipe II, nos va desvelando entresijos y secretos reales y del monasterio, que pocos conocen, mientras narra su vida a un amanuense, ya en sus últimos días. Por otro lado, se entremezcla otra narración donde miembros de ETA, descontentos con la entrega de armas, creyendo una traición para Euskalerría, son puestos en contacto con Terra Lliure, los extremistas armados catalanes, por un personaje misterioso que se esconde bajo el apodo de "La Clave", proponiéndoles atentar contra El Escorial como venganza personal, por haber sido relevado de su cargo, injustamente, por fines políticos? Pero tal venganza esconde unas misteriosas pistas (la primera de ellas es un anónimo únicamente con la letra griega PHI), que se acabará relacionando con el Jefe de los Servicios Antiterroristas de España y que enlaza, sorpresa tras sorpresa, para, al final, desvelar el Secreto de El Escorial...